IntegraGen : Comptes et Annexes 2023

RAPPORT DE

GESTION

2023

INTEGRAGEN

Société Anonyme au capital de 3.363.666 euros Siège social : Genopole Campus 1, Genavenir 8 5, rue Henri Desbruères - 91000 EVRY

RCS EVRY B 432 176 543

Mesdames, Messieurs,

Nous vous présentons le rapport de gestion sur les activités de la société pendant l'exercice ouvert le 1er janvier 2023 et clos le 31 décembre 2023 et soumettons à votre approbation les comptes annuels de cet exercice.

L'année 2023 a marqué une forme de retour à la normale après les trois années de pandémie, malgré des turbulences géopolitiques majeures et en particulier une forte inflation. IntegraGen, membre du Groupe OncoDNA, a continué à développer son portefeuille d'activités avec une croissance (hors activités liées au COVID) des services génomiques, des activités de services à la recherche clinique et à l'industrie.

Le résultat financier de l'année est à nouveau un excédent brut d'exploitation positif, qui montre que, malgré les investissements effectués pour l'obtention de certifications qualité au laboratoire, notre modèle économique est robuste.

L'année a également été marquée par l'annonce par le GCS SeqOIA de l'internalisation de la plateforme de séquençage opérée depuis 2019 par IntegraGen, ainsi que par l'attribution par le College of American Pathologists (CAP) de l'accréditation du laboratoire d'Évry. Ces changements ont entrainé un programme de réduction de coûts et une réduction des effectifs significatifs, mais également permettent d'envisager une forte croissance des activités de services à l'industrie pharmaceutique grâce à l'accréditation CAP et la certification CLIA.

Nous souhaitons une fois encore remercier tous nos clients qui demeurent fidèles et tous les employés des laboratoires et du développement qui par leur dévouement ont permis à IntegraGen de dépasser ses objectifs et de contribuer aux projets des chercheurs et des cliniciens et in fine à l'amélioration de la prise en charge des patients.

Nous sommes particulièrement fiers de vous présenter ces résultats et vous remercions pour votre confiance.

Nous vous proposons en outre de procéder à l'affectation des résultats de l'exercice clos le 31 décembre 2023. Les comptes arrêtés au 31 décembre 2023, comportant le bilan, le compte de résultat et l'annexe, ont été établis suivant les normes, principes et méthodes du plan comptable.

Bernard Courtieu

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PRESENTATION DE LA SOCIETE

1.1 Situation de la Société

La Société a été créée en 2000 et se consacre à la réalisation d'analyses génomiques visant à améliorer la recherche fondamentale et clinique ainsi que la prise en charge des maladies complexes liées aux altérations du génome, principalement en cancérologie et maladies génétiques rares.

A l'issue d'une offre publique d'achat amicale initiée par la société belge OncoDNA en juillet 2020, la Société a intégré le groupe OncoDNA afin de créer un leader européen en services génomiques et de diagnostiques spécialisé en cancérologie, ouvrant de nouvelles opportunités de marchés et de croissance en France et à l'international.

1.1.1. SERVICES GENOMIQUES

Laboratoire d'Évry

IntegraGen dispose d'une plateforme de séquençage et de génotypage à Évry. Son expertise repose sur une équipe reconnue, comprenant un laboratoire avec une équipe d'environ 15 personnes dédiée au séquençage très-haut débit ainsi qu'un groupe de bio-informaticiens et data managers traitant les données et ayant développé plusieurs outils d'aide à l'interprétation et à l'analyse de données génomiques.

Cette plateforme a permis à la Société de développer une offre de services génomiques pour des laboratoires académiques et privés.

Plus spécifiquement, sur le site d'Evry, IntegraGen mène de nombreux projets de séquençage et d'analyse des exomes et du génome pour les principaux centres de recherche ou de soins en cancérologie et les autres maladies génétiques.

Par ailleurs, IntegraGen réalise des prestations dans le cadre de projets de recherche clinique, permettant ainsi d'orienter la prise en charge des patients vers les thérapeutiques ciblées les plus adéquates.

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L'exercice couvrant la période allant du 1er janvier 2023 au 31 décembre 2023 était le vingt-troisième exercice de la Société. Depuis juin 2010, IntegraGen est cotée sur le marché Euronext Growth d'Euronext Paris (FR0010908723 ALINT). A la fin de l'année 2023, la Société comptait 56 collaborateurs en France.

Partenariat avec l'Institut Pasteur

En 2015, IntegraGen est devenue l'opérateur de séquençage de la Plateforme de Microbiologie Mutualisée (P2M) de l'Institut Pasteur. Le contrat a été renouvelé au début de l'année 2020 puis de nouveau en janvier 2022. P2M est dédiée au séquençage génomique des souches (bactéries, virus, champignons, parasites) que reçoivent les Centres nationaux de référence et les Centres collaborateurs de l'Organisation mondiale de la santé dans le cadre de la surveillance des maladies infectieuses. Ce contrat a renouvelé de nouveau en juillet 2023 jusqu'au 31 décembre 2024.

Plateforme SeqOIA

Le 27 juillet 2018, le Groupement Coopératif de Santé (GCS) SeqOIA (Sequencing, Omics, Information Analysis), composé de l'Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP), de l'Institut Curie et du centre de lutte contre le cancer Gustave Roussy, a annoncé avoir retenu l'offre d'IntegraGen dans le cadre de l'appel d'offres, lancé en avril 2018 relatif à la fourniture d'une prestation d'exploitation d'une plateforme de production de données de séquençage à haut débit.

SeqOIA est la plateforme génomique de Paris Région ayant été sélectionnée par le ministère des Solidarités et de la Santé pour la mise en œuvre et l'évaluation de projets pilotes de plateformes de séquençage très haut débit à visée sanitaire, dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025. Le GCS SeqOIA a pour objectif de réaliser des analyses de séquençage d'ADN (exomes et génomes complets) et d'ARN pour les patients atteints de cancers et de maladies rares.

La plateforme de séquençage est installée dans les locaux de l'ancien hôpital Broussais à Paris XIVème. L'acte d'engagement reçu par IntegraGen comprend une tranche ferme minimale de 16,4 M€ et maximale de 25,6 M€. Il s'étend sur cinq années s'achevant le 31 décembre 2023.

Le GCS SeqOIA a pris la décision d'internaliser l'exploitation de la plateforme à l'issue du marché de 2018. Néanmoins, afin d'assurer la transition, le contrat a été étendu jusqu'au 29 février 2024.

1.1.2. LOGICIELS

La société propose également trois logiciels d'assistance à l'interprétation des données de séquençage : SIRIUSTM, MERCURYTM et GALILEOTM.

SIRIUSTM est une solution en ligne basée sur le Big Data, destinée à permettre aux chercheurs de naviguer de façon rapide et intuitive dans les données d'exomes pour identifier les variants génétiques causaux dans les maladies rares à transmission Mendélienne, ou les variants somatiques en oncologie.

MERCURYTM est un outil d'assistance à l'interprétation des données d'exomes et de transcriptome en oncologie permettant aux biologistes et anatomo-pathologistes de transformer ces données en un rapport biologique rapidement utilisable en recherche clinique et translationnelle. Le logiciel a obtenu le marquage CE en 2020.

GALILEOTM a été lancé en 2019 ; il permet aux chercheurs d'analyser les données d'ARN.

Les logiciels sont disponibles commercialement en mode SaaS, grâce à la plateforme Google Cloud Platform.

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1.2 Faits marquants de l'exercice

Afin de préserver sa pérennité, IntegraGen a pris la décision à l'automne 2023 de mener un plan de sauvegarde de l'emploi. Les effectifs de la société diminueront de 16 emplois à l'issue de ce plan début 2024.

Cette décision reflète l'arrêt des activités réalisées pour le GCS SeqOIA, à la suite de la décision de celui- ci de ne pas renouveler le contrat de 2018 à son terme. Cette réduction s'inscrit également dans le recentrage stratégique qu'IntegraGen va opérer en développant une offre de suivi des marqueurs moléculaires de cancers dans les essais cliniques réalisés par des sociétés pharmaceutiques.

Ce recentrage est désormais permis par la certification CLIA (Clinical Laboratory Improvement Amendments) en décembre 2023 et par l'accréditation du College of American Pathologists (CAP) en janvier 2024.

Le label CLIA/CAP reconnait et garantit le respect par le laboratoire d'Évry des normes les plus élevées en matière d'essais de laboratoire clinique et la précision des diagnostics moléculaires d'une qualité supérieure, faisant ainsi d'IntegraGen un partenaire de référence pour les sociétés de Bio Pharma.

En 2023, les revenus liés aux opérations courantes ont diminué de 5% par rapport à l'année 2022. Ci- dessous une analyse de la progression des ventes par segment sur les trois derniers exercices (en milliers d'euros). Cette diminution reflète principalement la moindre activité liée à la pandémie de COVID-19 sur la plateforme P2M, ainsi que les projets réalisés à Évry pour celle-ci.

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Nous détaillerons les avancées d'IntegraGen dans chacune des lignes de produits :

• Les services génomiques (sur le graphe : Evry, SeqOIA et Pasteur)
• Les outils logiciels (SW) et les activités de genomic consulting (Geco)

Activités de services génomiques

Accroissement des séquençages pour le GCS SeqOIA en 2023 avant la fin annoncée des activités

Les opérations de la plateforme ont démarré début 2019 et se sont accrues en 2020 ainsi qu'en 2021, 2022 et 2023 par suite de l'accélération des séquençages de patients et à l'élargissement des indications. Ce contrat a permis de réaliser un chiffre d'affaires de 4.365 K€ au cours de l'exercice 2023, à comparer à 4.008 K€ en 2022.

Légère diminution des activités de services génomiques du laboratoire d'Évry

Les activités de services génomiques comprennent les prestations réalisées pour les laboratoires de recherche et les équipes en charge de recherche clinique, elles sont désormais concentrées sur le site d'Évry.

Le chiffre d'affaires annuel 2023 s'élève à 4.920K€, en diminution de 4%, principalement dû à la non récurrence de projets réalisés à Évry en 2022 pour la plateforme P2M et particulièrement liés à la pandémie, ainsi qu'à des projets retardés pour des sociétés pharma.

Au total, les équipes de génomique ont mené à bien plus de 482 projets pour 119 entités académiques et privées, pour un total de échantillons réceptionnés et traités dont 13.840 pour l'activité de NGS.

Prestations réalisées pour l'Institut Pasteur

IntegraGen a poursuivi des prestations au sein de la plateforme de microbiologie mutualisée (P2M) de l'Institut Pasteur.

L'activité liée au Covid-19 avait commencé à décroitre au second semestre 2022 pour laisser place à l'activité habituelle de microbiologie ce qui s'est confirmé en 2023.

En 2023, la plateforme a réalisé plus de 17 000 séquençages microbiens.

Logiciels et GeCo

La société propose trois logiciels distincts d'assistance à l'interprétation des données génomiques, disponibles sur le cloud en mode SaaS : MERCURY™, pour les données de patients atteints de tumeurs cancéreuses, SIRIUS™ pour l'analyse d'échantillons de recherche en particulier pour les applications de recherche en génétique constitutionnelle et pour l'analyse de transmissions Mendéliennes complexes, et enfin GALILEO™, pour l'analyse d'expression de l'ARN. Les logiciels ont généré en 2023 un chiffre d'affaires de 233 K€.

Dans le domaine GeCo (GeCo - Genomic Consulting », consistant à réaliser des prestations d'analyse de données génomiques), les revenus sont de 60 K€ pour 2023.

Impact de la crise sanitaire liée à la pandémie Covid-19

IntegraGen avait obtenu un Prêt Garanti par l'Etat auprès de la Société Générale, d'un montant de 1 800 000 euros en 2020, de façon à préserver la trésorerie et faire face à tout risque. Le remboursement de ce prêt a débuté comme prévu en juin 2022, s'est poursuivi en 2023 et s'étalera sur 5 années.

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Conformément aux dispositions du I de l'article L225-100-1 du Code de commerce, une présentation de la situation financière de la Société et de ses résultats sera développée ci-après.

2.1. Compte de résultat de IntegraGen SA

Les comptes annuels de l'exercice clos le 31 décembre 2023 que nous soumettons à votre approbation ont été établis conformément aux règles de présentation et aux méthodes d'évaluation prévues par la réglementation en vigueur.

Les méthodes d'évaluation retenues pour cet exercice sont identiques à celles de l'exercice précédent.

Ce tableau présente un résumé des comptes de l'exercice détaillés ci-après :

Revenus d'exploitation

Les revenus d'exploitation s'élèvent à 12.827 K€, en diminution de 5 de %. Ils comprennent les revenus des activités courantes à hauteur de 11.701 K€, la refacturation de frais de management et de personnel vers la maison-mère pour 835 K€ et d'autres revenus d'exploitation (reprise de provisions et transfert de charges) pour 290 K€.

Charges d'exploitation

• Frais de personnel

Les frais de personnel s'élèvent à 4.828 K€, en hausse de 6%. Les effectifs moyens pour 2023 sont stables à 55 comme en 2022.

A l'issue du plan social mené fin 2023 les effectifs s'élèvent à 43 personnes au 30 mars 2024.

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• Achats de consommables

Les achats de consommables se montent à 4.211K€, en diminution de 19% par rapport à l'exercice précédent. Cette diminution est essentiellement liée à la diminution de réactifs à l'Institut Pasteur.

• Autres dépenses d'exploitation

Les autres dépenses d'exploitation s'élèvent à 3.709 K€, stables par rapport à l'année 2022. Hors refacturation des frais de management et de personnel de la maison-mère pour 785K€, ces autres dépenses seraient en légère diminution de 2%. Les dépenses de marketing et R&D ont augmenté en 2023, notamment dans le cadre d'un accord avec C2I, destiné à nous apporter des études dans le futur.

Les autres dépenses comprennent, entre autres :

• Les locations mobilières et charges afférentes pour 734 K€
• Les locations immobilières pour 314K€
• Les coûts de maintenance (équipements de laboratoires et locaux) pour 461 K€
• Les honoraires (commissions, honoraires comptables, juridiques, propriété intellectuelle et divers) qui s'élèvent à 593 K€

Les honoraires, en augmentation par rapport à l'exercice 2022, incluent les frais du projet de certification CLIA-CAP qui permettra à l'entreprise de servir le secteur Bio-Pharma

Enfin, les autres dépenses d'exploitation incluent aussi les frais de déplacement, les redevances et jetons de présence, les taxes, les assurances et d'autres frais.

Excédent Brut d'Exploitation

Malgré la diminution des ventes et grâce à la maitrise des coûts en 2023, l'excédent brut d'exploitation est

• 81 K€ contre 62 K€ en 2022.
• • Dotation aux amortissements et aux provisions

Le montant total des dotations représente une charge de 198 K€ en 2023, en légère diminution par rapport à la charge de 2022 qui s'élevait à 202 K€.

• Total des charges d'exploitation

Le montant total des charges d'exploitation s'élève à 12.944 K€, en baisse de 5% par rapport à 2022

essentiellement dû à la diminution des réactifs Pasteur.

Résultat d'exploitation

La perte d'exploitation s'élève à 117 K€ en 2023 contre 139 K€ en 2022.

Résultat financier et résultat courant avant impôt

Le résultat financier est un gain de 40 K€ contre 67 K€ en 2022.

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Résultat exceptionnel

Le résultat exceptionnel représente une perte nette de 181 K€ contre 72 K€ en 2022. Il comprend notamment des indemnités payées suite au départ d'un cadre et une provision liée à la réorganisation entamée fin 2023 et finalisée début 2024.

Résultat net

Les efforts de recherche et développement ont permis de dégager un crédit d'impôt recherche de 11 K€ et un crédit Impôt Innovation de 76 K€. Le crédit impôt recherche a diminué suite à la finalisation de certains champs de recherches. Le crédit Impôt Innovation, lié aux efforts de développement dans le domaine des logiciels, est en légère diminution.

Le résultat net est une perte de 171 K€ comparé à une perte de 4 K€ en 2022.

2.2. Bilan de IntegraGen SA

ACTIF

Les immobilisations incorporelles, composées de logiciels et de licences, sont totalement amorties à ce jour.

Les immobilisations corporelles s'élèvent à la somme nette de 143 K€ en baisse par rapport à fin 2022. Il s'agit d'équipements industriels, de matériel et de mobiliers d'une valeur brute de 2.093 K€.

Le poste « immobilisations financières » s'élève au 31 décembre 2023 à 172 K€ contre 191 K€ en 2022. Ce montant comprend, à hauteur de 63,19 K€ les liquidités et la valeur nette des titres présents au 31 décembre 2023 dans le cadre du contrat de liquidité et la valeur des titres auto détenus par IntegraGen (49, 73 K€) hors contrat de liquidité.

L'actif circulant s'élève à la somme de 7.684 K€. Ce poste comprend des stocks pour 311 K€, des créances pour 4.495 K€ et des disponibilités pour 2.879 K€.

La trésorerie à fin 2023 s'élève à 2.879 K€ contre 4.507 K€ à fin 2022. Pour l'année 2023, le flux net de trésorerie est de -1.629 K€ y inclut la variation du besoin en fonds de roulement, le prêt de 1.000 K€ à la maison-mère ainsi qu'un prêt à court terme de 160 KUSD (=149 K€) également à la maison-mère.

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