Le président Julius Maada Bio a qualifié la chute du célèbre arbre de "grande perte pour la nation", alors que des foules se sont rassemblées pour admirer le tronc détruit.
Le "Cotton Tree" était le point de repère le plus important de ce pays d'Afrique de l'Ouest, fondé par des esclaves américains affranchis.
On pense que lorsque ces esclaves sont arrivés par bateau à la fin des années 1700, ils se sont rassemblés sous ses branches pour prier avant de s'installer dans leur nouvelle maison.
"Il était considéré comme un symbole de liberté par les premiers colons", a écrit le président sur Twitter.
"Nous aurons quelque chose au même endroit qui témoignera de la place qu'occupe le grand Cotton Tree dans notre histoire. Toutes les voix seront réunies pour cela".
Le kapokier se trouvait au milieu d'un rond-point dans le centre de Freetown, près du musée national et du bureau du président.
Un passant, Victor Tutu Rogers, a déclaré à Reuters qu'il avait vu l'arbre tomber vers 21 h 40 (2140 GMT) mercredi.
"Le vent soufflait, la pluie était forte. J'ai contourné le cotonnier en revenant du travail, car je craignais que les branches ne tombent", a-t-il dit.
"Peu après, il y a eu un violent éclair et j'ai entendu une forte détonation - le bruit de l'arbre qui tombait derrière moi.
Jeudi, les branches et les débris avaient été enlevés, ne laissant qu'une souche.
"En tant que municipalité, il s'agissait d'un événement très symbolique, l'endroit où nous tenons notre action de grâce annuelle chaque année en novembre pour offrir des prières et pour de nombreux autres événements", a déclaré l'administrateur en chef de la ville, Festus Kallay.
"L'horizon de Freetown ne sera plus jamais le même.
