Au 31 décembre 2021, Nanobiotix estimait disposer d'environ 83,9 millions d'euros de trésorerie contre 119,2 millions au 31 décembre 2020. Grâce à des ajustements de l'efficience opérationnelle entrepris au cours du second semestre 2021, Nanobiotix a été en mesure d'étendre sa visibilité financière et prévoit désormais que sa trésorerie et ses investissements au 31 décembre 2021, à l'exclusion du versement éventuel de tout paiement d'étape à son bénéfice dans le cadre de ses collaborations, lui permettront de financer ses plans opérationnels jusqu'au second trimestre 2023.