Le Nikkei était en baisse de 0,23% à 33 370,40 à la mi-journée, après avoir ouvert en hausse de 0,22%.
"Le Nikkei n'a pas réussi à dépasser son plus haut niveau de clôture en trois décennies, atteint le 3 juillet, à trois reprises récemment", a déclaré Jun Morita, directeur général du département de recherche de Chibagin Asset Management.
"Dans ces conditions, les investisseurs à court terme ont voulu vendre des actions afin de réaliser des profits pour le moment.
Le 20 novembre, l'indice a atteint son plus haut niveau depuis mars 1990 et il s'en est approché lors de deux séances depuis lors.
Toutefois, aucune de ces séances n'a clôturé à un niveau supérieur à celui du 3 juillet.
L'indice élargi Topix était en baisse de 0,45 % à 2 371,13, Toyota Motor ayant chuté de 1,03 % pour tirer l'indice vers le bas.
Seiichi Suzuki, analyste en chef du marché des actions à l'Institut de recherche Tokai Tokyo, a déclaré que le sentiment a également été affecté par la hausse du yen, qui a provoqué une liquidation.
Le yen s'est maintenu autour de 148,10 alors que le dollar américain a atteint son niveau le plus bas depuis trois mois face à ses pairs mardi, après avoir baissé dans la nuit suite à des données plus faibles que prévu sur les ventes de nouveaux logements.
Le propriétaire de la marque Uniqlo a augmenté de 1,48% et l'investisseur technologique SoftBank Group a gagné 0,28%. L'opérateur de magasins de meubles et d'articles ménagers Nitori Holdings a augmenté de 2,05%.
Le titre Taisho Pharmaceutical n'a pas encore été négocié en raison d'une surabondance d'ordres d'achat, après avoir atteint son plafond quotidien lors de la séance précédente.
Le fabricant de médicaments a annoncé la semaine dernière un rachat par la direction à 8 620 yens par action, ce qui rendrait la société privée. L'action était cotée à sa limite supérieure quotidienne de 7 545 yens à la mi-journée.
La société de négoce Sojitz a fait un bond de 7,15 % pour devenir le titre le plus performant du Nikkei.
Le fabricant de téléviseurs Sharp a perdu 7,93% et a été le plus mauvais élève de l'indice.